彻底摧毁阿古柏政权、收复伊犁是新疆和我国各族人民的共同利益和愿望。在维吾尔族和新疆各族人民的支持和协助下，1877年清军取得了讨伐阿古柏得胜利。1881年，中、俄两国签订《伊犁条约》。中国虽然收复了伊犁，却失去霍尔果斯河以西7万多平方公里之地，赔款900万卢布。在此之前，沙俄通过1860年的《中俄北京条约》和1864年的《中俄勘分西北界约记》两个不平等条约，已经强割中国西北地区44万多平方公里的土地。不仅如此，沙俄还在不得不交还伊犁时继续作恶，用武力劫走当地维吾尔、回、蒙古、哈萨克、柯尔克孜等族人民达10万人之多。与此同时，侵略军肆意破坏农田、水渠、房屋、果园，抢劫粮食、牲畜。伊犁九城有五城几成废墟，有三城只剩下颓垣瓦砾一片。伊犁河右岸九个乡的维吾尔族人民，所有财物也被洗劫殆尽。
